Natsume Yuujinchou, doğaüstü olaylarla iç içe geçmiş günlük olayları konu alan bir anime serisidir. Ana karakter Takashi Natsume, ailesini küçük yaşta kaybetmiş, ruhları görebilme yeteneğine sahip bir çocuktur. Bu yeteneği onun hem dışlanmasına hem de yanında kaldığı akrabalarının arasında yalnız kalmasına yol açmıştır. Ta ki son olarak Fujiwara çiftinin yanına yerleşene dek.
Yeni taşındığı bu kasabada, geçmişte burada yaşamış olan büyükannesi Reiko Natsume’nin izleriyle karşılaşır. Reiko da torunu gibi ruhları görebilen, güçlü ama yalnız bir kadındır. Ruhlarla yaptığı mücadeleler sonunda onların isimlerini bir kitaba yazmış ve bu kitap Natsume’ye miras kalmıştır: Arkadaşlar Kitabı.
Natsume, kitabı kullanarak ruhların isimlerini onlara geri verirken, sadece onların özgürlüklerini iade etmekle kalmaz; aynı zamanda onların geçmişlerine, duygularına ve kayıplarına da tanıklık eder. Her isimle birlikte bir hatıra, bir yara, bazen bir veda gelir.
Bu yolculukta Natsume’nin en yakın yol arkadaşı, kedi formunda ama aslında güçlü bir ruh olan Madara ya da takma adıyla Nyanko-sensei’dir. Başta sadece kitabın gücüne göz diken, biraz obur ve alaycı görünen Nyanko-sensei, zamanla Natsume için bir koruyucuya, dostlukla sarmalanmış bir aile figürüne dönüşür. Aralarındaki ilişki, serinin hem en eğlenceli hem de en sıcak yönlerinden biridir.